MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 2837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017104	CTGG	2	8	168171	168178	0 %	25 %	50 %	25 %	384117701
2502	NC_017104	GCA	2	6	168187	168192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117701
2503	NC_017104	CGGA	2	8	168342	168349	25 %	0 %	50 %	25 %	384117701
2504	NC_017104	CGAT	2	8	168365	168372	25 %	25 %	25 %	25 %	384117701
2505	NC_017104	GCG	2	6	168398	168403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117701
2506	NC_017104	TCG	2	6	168523	168528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117701
2507	NC_017104	GAA	2	6	168548	168553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117701
2508	NC_017104	TCA	2	6	168565	168570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117701
2509	NC_017104	CTT	2	6	168605	168610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117701
2510	NC_017104	C	6	6	168639	168644	0 %	0 %	0 %	100 %	384117701
2511	NC_017104	TGGT	2	8	168664	168671	0 %	50 %	50 %	0 %	384117701
2512	NC_017104	GCCA	2	8	168736	168743	25 %	0 %	25 %	50 %	384117701
2513	NC_017104	AC	3	6	168796	168801	50 %	0 %	0 %	50 %	384117701
2514	NC_017104	CGA	2	6	168836	168841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117701
2515	NC_017104	TG	3	6	169011	169016	0 %	50 %	50 %	0 %	384117701
2516	NC_017104	CCGC	2	8	169027	169034	0 %	0 %	25 %	75 %	384117701
2517	NC_017104	CAC	2	6	169035	169040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117701
2518	NC_017104	TG	3	6	169083	169088	0 %	50 %	50 %	0 %	384117701
2519	NC_017104	CCG	2	6	169342	169347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117701
2520	NC_017104	GAT	2	6	169353	169358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117701
2521	NC_017104	T	6	6	169370	169375	0 %	100 %	0 %	0 %	384117701
2522	NC_017104	TGC	2	6	169726	169731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117702
2523	NC_017104	TGC	2	6	169734	169739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117702
2524	NC_017104	CGG	2	6	169792	169797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117702
2525	NC_017104	CAC	2	6	169894	169899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117702
2526	NC_017104	GGT	2	6	169933	169938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117702
2527	NC_017104	CAC	3	9	169947	169955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117702
2528	NC_017104	GGAT	2	8	170010	170017	25 %	25 %	50 %	0 %	384117702
2529	NC_017104	CAG	2	6	170151	170156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117702
2530	NC_017104	CGA	2	6	170200	170205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117702
2531	NC_017104	GCT	2	6	170246	170251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117702
2532	NC_017104	GGCA	2	8	170286	170293	25 %	0 %	50 %	25 %	384117702
2533	NC_017104	GAT	2	6	170294	170299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117702
2534	NC_017104	GCC	3	9	170443	170451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117702
2535	NC_017104	CG	3	6	170470	170475	0 %	0 %	50 %	50 %	384117702
2536	NC_017104	TGG	2	6	170506	170511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117702
2537	NC_017104	GCA	2	6	170591	170596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117702
2538	NC_017104	ACG	2	6	170640	170645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117702
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2540	NC_017104	GAA	2	6	170715	170720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117702
2541	NC_017104	CGT	2	6	170756	170761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117702
2542	NC_017104	CA	3	6	170771	170776	50 %	0 %	0 %	50 %	384117702
2543	NC_017104	CAC	2	6	170802	170807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117702
2544	NC_017104	GCC	2	6	170808	170813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117702
2545	NC_017104	TGAG	2	8	170872	170879	25 %	25 %	50 %	0 %	384117703
2546	NC_017104	TTTC	2	8	170902	170909	0 %	75 %	0 %	25 %	384117703
2547	NC_017104	CAG	2	6	171029	171034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117703
2548	NC_017104	CAGC	2	8	171059	171066	25 %	0 %	25 %	50 %	384117703
2549	NC_017104	CAG	2	6	171158	171163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117703
2550	NC_017104	GCA	2	6	171186	171191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117703
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2552	NC_017104	CCA	2	6	171441	171446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117703
2553	NC_017104	GCC	2	6	171504	171509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117703
2554	NC_017104	CCA	2	6	171535	171540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117703
2555	NC_017104	GCC	2	6	171554	171559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117703
2556	NC_017104	CGC	2	6	171592	171597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117703
2557	NC_017104	CAG	2	6	171656	171661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117703
2558	NC_017104	GCCATC	2	12	171668	171679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384117703
2559	NC_017104	AG	3	6	171771	171776	50 %	0 %	50 %	0 %	384117703
2560	NC_017104	GTG	2	6	171804	171809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117703
2561	NC_017104	CAT	2	6	171821	171826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117703
2562	NC_017104	GCA	2	6	171855	171860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117704
2563	NC_017104	GAA	2	6	171973	171978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117704
2564	NC_017104	CA	3	6	172121	172126	50 %	0 %	0 %	50 %	384117704
2565	NC_017104	TCCGG	2	10	172164	172173	0 %	20 %	40 %	40 %	384117704
2566	NC_017104	GCA	2	6	172186	172191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117704
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2569	NC_017104	TCA	2	6	172217	172222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117704
2570	NC_017104	TCGCG	2	10	172224	172233	0 %	20 %	40 %	40 %	384117704
2571	NC_017104	CGG	2	6	172277	172282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117704
2572	NC_017104	ACA	2	6	172328	172333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117704
2573	NC_017104	CCCGG	2	10	172431	172440	0 %	0 %	40 %	60 %	384117705
2574	NC_017104	CAC	2	6	172566	172571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117705
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2577	NC_017104	GGC	2	6	172770	172775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117705
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2580	NC_017104	GCA	2	6	172915	172920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117705
2581	NC_017104	GTC	2	6	172948	172953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117705
2582	NC_017104	CAG	2	6	172985	172990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117705
2583	NC_017104	GTCCG	2	10	173035	173044	0 %	20 %	40 %	40 %	384117705
2584	NC_017104	GCCC	2	8	173236	173243	0 %	0 %	25 %	75 %	384117705
2585	NC_017104	AGC	2	6	173251	173256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117705
2586	NC_017104	TGC	2	6	173302	173307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117705
2587	NC_017104	GC	3	6	173306	173311	0 %	0 %	50 %	50 %	384117705
2588	NC_017104	GCC	2	6	173400	173405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117705
2589	NC_017104	GCC	2	6	173560	173565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117706
2590	NC_017104	CAT	2	6	173618	173623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117706
2591	NC_017104	GA	3	6	173716	173721	50 %	0 %	50 %	0 %	384117706
2592	NC_017104	AGC	2	6	173734	173739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117706
2593	NC_017104	CTC	2	6	173740	173745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117706
2594	NC_017104	TGATC	2	10	173785	173794	20 %	40 %	20 %	20 %	384117706
2595	NC_017104	TGA	2	6	173847	173852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117706
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2597	NC_017104	TTC	2	6	173924	173929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117706
2598	NC_017104	TCA	2	6	173938	173943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117706
2599	NC_017104	GC	3	6	173951	173956	0 %	0 %	50 %	50 %	384117706
2600	NC_017104	CCA	2	6	174013	174018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117706
2601	NC_017104	ACG	2	6	174171	174176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117706
2602	NC_017104	CCA	2	6	174205	174210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117706
2603	NC_017104	ATG	2	6	174231	174236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117706
2604	NC_017104	CGC	2	6	174265	174270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117706
2605	NC_017104	GCTG	2	8	174282	174289	0 %	25 %	50 %	25 %	384117706
2606	NC_017104	CGG	2	6	174358	174363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117706
2607	NC_017104	GCA	2	6	174438	174443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117706
2608	NC_017104	AG	3	6	174490	174495	50 %	0 %	50 %	0 %	384117707
2609	NC_017104	ACG	2	6	174524	174529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117707
2610	NC_017104	AGG	2	6	174534	174539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117707
2611	NC_017104	GGCA	2	8	174631	174638	25 %	0 %	50 %	25 %	384117707
2612	NC_017104	GCC	2	6	174647	174652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117707
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2614	NC_017104	TTG	2	6	174678	174683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117707
2615	NC_017104	TCA	2	6	174708	174713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117707
2616	NC_017104	CAG	2	6	174764	174769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117707
2617	NC_017104	TAA	2	6	174862	174867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384117707
2618	NC_017104	GAA	2	6	175349	175354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117708
2619	NC_017104	ACACC	2	10	175358	175367	40 %	0 %	0 %	60 %	384117708
2620	NC_017104	TTC	2	6	175377	175382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117708
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2622	NC_017104	GC	5	10	175419	175428	0 %	0 %	50 %	50 %	384117708
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.